30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2334 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  44.33 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  42.59 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.9 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  40.37 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  48.1 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  39.2 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  35.95 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  38.97 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  32.19 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  35.04 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  39.13 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  35.94 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  43.18 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  41.86 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  28.37 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  35.37 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  41.56 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  35.05 
 
 		 590 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  36.96 
 
 		 255 aa  44.7  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  37.84 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  43.04 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  27.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 262 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  37.8 
 
 		 200 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 262 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 262 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  30.6 
 
 		 280 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>