38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1745 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  32.87 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  33.77 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  33.1 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  41.94 
 
 		 229 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  41.86 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.79 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  41.77 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  40.96 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  29.58 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  29.94 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  42.65 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  42.65 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  36.71 
 
 		 590 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  40 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  41.18 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.25 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  42.65 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  41.03 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  36.71 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  31.08 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 635 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  35.58 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  28.86 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.34 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  35.29 
 
 		 327 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  32.26 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  36.36 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  25.36 
 
 		 268 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 247 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  40.85 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>