30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3129 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  100 
 
 
304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  41.23 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  42.71 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  38.06 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  30.53 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  30.3 
 
 
590 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.46 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.11 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  34.86 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  35.08 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  31.84 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  29.64 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  32.75 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  34.22 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  31.87 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  34.5 
 
 
242 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.43 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  33.84 
 
 
265 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  33.33 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  33.53 
 
 
229 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  29.71 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  34.91 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  31.4 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4439  RDD  31.75 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  34.86 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  30.23 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
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NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  32.16 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  54.55 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  27.68 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  25.81 
 
 
237 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
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