72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0824 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  100 
 
 		 590 aa  1170    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  43.49 
 
 		 261 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  35.47 
 
 		 254 aa  123  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  36.73 
 
 		 258 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  32.34 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  30.65 
 
 		 265 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  28.95 
 
 		 322 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  29.19 
 
 		 284 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  31.51 
 
 		 288 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  33.33 
 
 		 241 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  30.37 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  32.05 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  32.6 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  32.58 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  30.19 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  35.85 
 
 		 229 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  33.85 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  29.29 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1509  hypothetical protein  26.52 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  27.87 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1482  hypothetical protein  26.52 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  32.07 
 
 		 269 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  33.74 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  44.58 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  36.05 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  25.3 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  32.05 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  28.81 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.9 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.71 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  32.12 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  34.76 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  27.69 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  27.66 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  32.05 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  37.78 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  26.38 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  46.67 
 
 		 80 aa  57.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  26.62 
 
 		 306 aa  57  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 151 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  31.79 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  25.26 
 
 		 272 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 202 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 247 aa  53.9  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  26.39 
 
 		 231 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  30.41 
 
 		 266 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  27.35 
 
 		 285 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.37 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 200 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  32.97 
 
 		 140 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.81 
 
 		 170 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  23.83 
 
 		 323 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  30.22 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.25 
 
 		 145 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 635 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  22.41 
 
 		 241 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 187 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  26.49 
 
 		 238 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  44 
 
 		 177 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  30.33 
 
 		 288 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 217 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  26.19 
 
 		 137 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  28.95 
 
 		 155 aa  43.5  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>