16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0461 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0461  RDD  100 
 
 		 323 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  47.28 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  40.58 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  37.21 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  27.63 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.55 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  25.38 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  30.41 
 
 		 241 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  27.07 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  24.73 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  29.21 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  23.78 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  24.76 
 
 		 590 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  30.32 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  25.76 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>