83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1489 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  100 
 
 		 155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.83 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  35.25 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  29.1 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  35.56 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  29.66 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.28 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.58 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.48 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  39.47 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  42.47 
 
 		 327 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  33.57 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  34.48 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  34.82 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  28.99 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  34.82 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  34.82 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  29.66 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  29.25 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  34.95 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  34.95 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  34.95 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  34.21 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  30.39 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  34.95 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  27.69 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 536 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.57 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  33.96 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  28.71 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  35.53 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.28 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  25.52 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  34.31 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  33.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  29.11 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  32.18 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  27.15 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  37.84 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.72 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  25.97 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  36.19 
 
 		 229 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  28.95 
 
 		 590 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.21 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.52 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  28.67 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  27.34 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.21 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  27.52 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.21 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  37.33 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.91 
 
 		 634 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  29.87 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  24.48 
 
 		 261 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  40.58 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  29.9 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  32.63 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.5 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  32.18 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  29.85 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  30 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  28.83 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  29.01 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  21.23 
 
 		 136 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>