47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1619 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1619  RDD  100 
 
 		 137 aa  280  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  31.78 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  31.3 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  30.53 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  27.74 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  35.16 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  27.4 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  27.97 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  27.4 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  27.4 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  38.89 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  28.23 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  26.03 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  27.91 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  27.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  27.4 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  26.53 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  27.89 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.11 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  35.53 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  26.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  26.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  26.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  26.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  27.71 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  26.95 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  25.34 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  26.09 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.95 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  26.71 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  26.8 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  29.87 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  33.8 
 
 		 141 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  25.19 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.74 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.12 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  27.78 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  30.23 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  28.92 
 
 		 158 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>