73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2137 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  100 
 
 		 165 aa  318  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  43.2 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  34.18 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  40.68 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  37.72 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  43.68 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  43.04 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  37.79 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  34.67 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  36.16 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  32.54 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  32.94 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  34.18 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  31.41 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  31.54 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  31.55 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  38.33 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.79 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  34.42 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  31.54 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  29.87 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  40.52 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  36.97 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  29.56 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  37.89 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  31.68 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  31.1 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  29.22 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  33.12 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  33.12 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  33.12 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  27.27 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  30.23 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  33.14 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  32.48 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  33.12 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  32.48 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  34.65 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  34.48 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  39.76 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  32.2 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  30.3 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  31.87 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  29.45 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  29.56 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  27.83 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  26.54 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  33.94 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  34.31 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  35.19 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  30.13 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  31.18 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  28.45 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  28.4 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  27.65 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  31.18 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  31.18 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  29.73 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  29.73 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  26.17 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>