65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3318 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3318  RDD  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  75.84 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  73.86 
 
 		 154 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  70.67 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  66.46 
 
 		 160 aa  231  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  73.1 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  66.25 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  69.66 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  66.67 
 
 		 189 aa  215  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  50.96 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  48.75 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  45.86 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  49.04 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  49.67 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  49.67 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  49.67 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  49.67 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  49.67 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  49.02 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  46.15 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  46.15 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  45.51 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  46.15 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  47.02 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  48.08 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  46.36 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  45.52 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  46.21 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  40.38 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  41.51 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  42.86 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  40.38 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  40.54 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  32.9 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.12 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  35.95 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  36.88 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  22.73 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  26.42 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  23.98 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  26.9 
 
 		 224 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  27.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  23.08 
 
 		 217 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  24.42 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  23.53 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  23.98 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  26.14 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  26.95 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  23.26 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  23.26 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  23.26 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  27.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  22.09 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  29.36 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.28 
 
 		 165 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  30.46 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  24.39 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0949  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  25.16 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>