13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06647 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  29.35 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  30.43 
 
 
174 aa  43.5  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  34.18 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  32.1 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  37.84 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  31.53 
 
 
389 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  28.97 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  40.28 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  26.32 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  29.13 
 
 
174 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  26.17 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>