55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1957 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  99.35 
 
 		 186 aa  313  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  77.48 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  71.24 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  69.93 
 
 		 174 aa  224  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  68.63 
 
 		 166 aa  222  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  73.86 
 
 		 160 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  71.72 
 
 		 189 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  66.01 
 
 		 181 aa  209  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  54.73 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  54.73 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  52.03 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  54.73 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  53.21 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  53.21 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  54.42 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  50 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  52.7 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  50.68 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  47.77 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  51.03 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  51.03 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  51.03 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  51.03 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  51.77 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  50 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  49.66 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  51.06 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  41.78 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  42.38 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  43.42 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  41.89 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  37.5 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  38.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.1 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  32.69 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  35.4 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  32.43 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  32.39 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.91 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  27.15 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  26.53 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  27.73 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  25.66 
 
 		 163 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  25.96 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  30.49 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  26.47 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  26.89 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  26.89 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  26.89 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>