58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1713 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  87.66 
 
 		 174 aa  280  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  69.28 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  68.63 
 
 		 154 aa  222  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  70.86 
 
 		 179 aa  218  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  72.22 
 
 		 189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  66.23 
 
 		 181 aa  217  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  69.18 
 
 		 160 aa  216  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  69.66 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  52.41 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  52.41 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  52.41 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  51.72 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  51.72 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  51.72 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  52.74 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  48.28 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  47.44 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  50.68 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  45.27 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  52.05 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  48.63 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  47.26 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  47.26 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  47.59 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  47.18 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  48.59 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  47.95 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  46.85 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  45.58 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  44.9 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  41.61 
 
 		 182 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  31.21 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.91 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  31.54 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  36.61 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  35.03 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  29.14 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  29.79 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.41 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  26.62 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  34.21 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  42.22 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  31.62 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  29.07 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  32.65 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  41.86 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  26.32 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  28.38 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>