69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0529 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  50.33 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  50.33 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  50.66 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  42.77 
 
 		 184 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  40.54 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  40.54 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  39.86 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  39.86 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  35.29 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  36.49 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  37.84 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  38.78 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  39.6 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  38.93 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  37.58 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  41.5 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  35.81 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  37.11 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  34.44 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  33.99 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  33.99 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  32.21 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.61 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.7 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  33.1 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  27.74 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  33.9 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  46.3 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  26.32 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  26.61 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  26.42 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  27.83 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  34.12 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  42.22 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  23.21 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  31.19 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.8 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  31.53 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  27.08 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  24.5 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  24.07 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  22.64 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  25.41 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  30.61 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 323 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3846  RDD domain-containing protein  23.64 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000267643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  21.7 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  26.05 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2719  RDD domain-containing protein  23.17 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000151483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  47.37 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  38.3 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  25.81 
 
 		 184 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  26.85 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  33.33 
 
 		 261 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>