78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0339 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  59.63 
 
 
224 aa  276  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  64.71 
 
 
217 aa  262  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  27.57 
 
 
157 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  28.22 
 
 
178 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  30.3 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  25.29 
 
 
178 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  39.62 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  25.44 
 
 
145 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  27.44 
 
 
154 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  29.13 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  24.1 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  22.42 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  25.29 
 
 
138 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  28.93 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  32.8 
 
 
159 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  27.95 
 
 
160 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  33.06 
 
 
169 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  25.3 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  32.8 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  22.53 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  26.25 
 
 
179 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  23.78 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  23.43 
 
 
160 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  34.55 
 
 
169 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  28.72 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  24.58 
 
 
165 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  33.33 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 
169 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  33.64 
 
 
169 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  38.61 
 
 
169 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  29.2 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 
169 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  29.52 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  26.87 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  29.56 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  25 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  27.52 
 
 
160 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  25.2 
 
 
173 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  33.98 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  25.21 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 
169 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  36.63 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  31.78 
 
 
168 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  27.1 
 
 
182 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  23.62 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  24.62 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  41.86 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  26.21 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  30.36 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  30.39 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  20.61 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  30.39 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  30.39 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  29.82 
 
 
147 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  26.53 
 
 
154 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  20.61 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  20.61 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  30.28 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  26.89 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  27.35 
 
 
177 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  21.21 
 
 
162 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  35.56 
 
 
140 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  30.53 
 
 
168 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  30.53 
 
 
168 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  30.53 
 
 
168 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  29.41 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  27.45 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  28.42 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  29.41 
 
 
169 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>