96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0539 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  100 
 
 		 163 aa  318  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  69.57 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  57.82 
 
 		 279 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  59.71 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  40.13 
 
 		 184 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  34.53 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.92 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.92 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.92 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  36.62 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  37.59 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  34.01 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.93 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.56 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.38 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.08 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  35.21 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  45.33 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  32.52 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  32.52 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  32.52 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  32.52 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  36.44 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  32.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  32.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  32.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  44 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  32.91 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  29.28 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  34.42 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  30.3 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  31.29 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  29.88 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  30.49 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  30.63 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  37.93 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  29.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  34.95 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  35.16 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  28.75 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  28.98 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  28.75 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  28.42 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  28.9 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  30.53 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  30.82 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  26.55 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0572  hypothetical protein  34.95 
 
 		 125 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  28.12 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  28.12 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  29.03 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  29.44 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  34.12 
 
 		 406 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  28.12 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  28.93 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  28.12 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  28.93 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  25.62 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  30.06 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  28.49 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  29.13 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  38.37 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  28.83 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  32.91 
 
 		 634 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0591  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  32.26 
 
 		 328 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  27.08 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  28.93 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  27.12 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  27.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  32.14 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  25.66 
 
 		 186 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  25.66 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  26.97 
 
 		 166 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.47 
 
 		 270 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 269 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>