61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2313 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  353  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  87.66 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  70.59 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  73.29 
 
 		 160 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  69.93 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  72.19 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  66.88 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  71.53 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  73.1 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  53.1 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  53.1 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  53.1 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  51.32 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  52.41 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  51.32 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  50.34 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  54.11 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  50.34 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  52.05 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  45.95 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  52.05 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  50.7 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  50 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  49.32 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  49.32 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  49.66 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  47.95 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  50 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  47.55 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  46.94 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  46.26 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  45.27 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  33.33 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.1 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  35.86 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  35.26 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  32.08 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  36.54 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  31.54 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  28.83 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  34.21 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  31.75 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30.95 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30.95 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30.95 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.48 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  30.48 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  30.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  28.67 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  44.19 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  27.96 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  36.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  31.63 
 
 		 159 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  28.74 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  28.48 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  25.51 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>