130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0678 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  304  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  41.41 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  38.3 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  44.7 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  37.72 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  40.16 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  35.21 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.78 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  35.92 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  38.03 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  34.44 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  37.32 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  31.37 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  38.28 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  33.1 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  33.1 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  33.8 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  38.06 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  39.69 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  31.43 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  30.72 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  35.21 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  35.1 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  36.42 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  30.07 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  31.94 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  29.14 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  36.73 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.87 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  30.99 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  43.42 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  43.37 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  30.49 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  33.8 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  45 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  32.12 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  28.47 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  35.25 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  31.79 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  32.65 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  34.04 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  31.37 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  30.71 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  33.64 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  28.77 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  32.56 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  28.92 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  31.76 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  34.88 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  36.78 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  36.36 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  29.46 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.18 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  30.41 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  25.3 
 
 		 220 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  31.39 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  35.48 
 
 		 202 aa  51.2  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  37.21 
 
 		 406 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.43 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  33.04 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  32.69 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  33.97 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  34.78 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  39.42 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  31.08 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  31.11 
 
 		 328 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  27.27 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  26.75 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  28.26 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  30.25 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  34.07 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  34.07 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  34.07 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  27.1 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  29.31 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>