63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1741 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  77.78 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  77.48 
 
 		 154 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  70.2 
 
 		 160 aa  227  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  72.19 
 
 		 174 aa  223  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  70.86 
 
 		 166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  69.68 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  64.6 
 
 		 181 aa  213  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  67.76 
 
 		 189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  47.22 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  50.57 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  51.55 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  54.9 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  54.9 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  54.9 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  50.6 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  54.25 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  54.25 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  54.25 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  48.31 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  47.17 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  47.17 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  47.17 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  47.17 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  49.04 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  47.68 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  48.28 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  46.9 
 
 		 146 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  43.11 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  43.1 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  39.33 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  43.23 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  42.36 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  37.58 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  34.97 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  37.72 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.13 
 
 		 137 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  31.35 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  36.13 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  33.72 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  34.16 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  34.94 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  27.96 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  32.24 
 
 		 323 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  25.57 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  28.83 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  26.26 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  22.62 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  24.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  26.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  28.3 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  25.45 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  26.8 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  23.56 
 
 		 162 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  27.68 
 
 		 157 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  37.97 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  27.43 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  27.03 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  27.52 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  28.3 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>