58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1765 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  99.35 
 
 		 154 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  77.42 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  71.07 
 
 		 160 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  71.71 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  70.59 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  75.5 
 
 		 160 aa  227  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  69.28 
 
 		 166 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  64.25 
 
 		 181 aa  220  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  48.92 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  50.89 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  55.63 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  55.63 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  50.94 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  55.63 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  54.09 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  54.09 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  54.97 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  49.7 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  51.95 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  51.95 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  46.63 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  48.75 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  50.61 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  51.95 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  50.34 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  51.77 
 
 		 146 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  40.94 
 
 		 181 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  43.86 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  51.06 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  45.28 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  43.48 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  38.06 
 
 		 138 aa  88.2  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.55 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  36.97 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  32.7 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  32.7 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  25.7 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  28.23 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  25.56 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  26.36 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  25.56 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 162 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  31.33 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  29.27 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  25 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  27.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  24.44 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  22.64 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 		 157 aa  42  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  25.66 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>