79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0913 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  84.48 
 
 		 174 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  83.33 
 
 		 174 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  86.39 
 
 		 169 aa  303  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  82.14 
 
 		 169 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  81.55 
 
 		 169 aa  290  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  80.36 
 
 		 169 aa  288  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  80.95 
 
 		 169 aa  288  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  80.36 
 
 		 169 aa  288  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  80.95 
 
 		 169 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  80.95 
 
 		 169 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  80.95 
 
 		 169 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  80.95 
 
 		 169 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  73.81 
 
 		 169 aa  264  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  67.46 
 
 		 170 aa  249  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  75 
 
 		 169 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  48.19 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  41.25 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  35.81 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  36.05 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  31.43 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.7 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  38.03 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30.12 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30.12 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30.12 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30.81 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.38 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  31.17 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  28.38 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  29.79 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  29.22 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  27.82 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  33.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  31.82 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  32 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  28.44 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  30.84 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  35.29 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  28.57 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  26.62 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  29.51 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  27.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  27.52 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  39.58 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  39.58 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  25.4 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  30.59 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  39.58 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  28.12 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0572  hypothetical protein  27.68 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  27.54 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>