81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2026 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  346  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  72.83 
 
 
173 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  70.06 
 
 
174 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  64.2 
 
 
170 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  64.94 
 
 
169 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  64.94 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  64.94 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  64.94 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  64.29 
 
 
169 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  64.29 
 
 
169 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  69.62 
 
 
168 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  69.62 
 
 
168 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  68.99 
 
 
168 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  66.67 
 
 
168 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  67.53 
 
 
169 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  68.03 
 
 
146 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  65.99 
 
 
146 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  51.97 
 
 
179 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1765  RDD domain-containing protein  50.67 
 
 
186 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  49.02 
 
 
189 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1713  RDD domain-containing protein  52.05 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.413729  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2313  hypothetical protein  52.05 
 
 
174 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.819704  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  50.66 
 
 
181 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1957  RDD domain containing protein  50 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  48.73 
 
 
186 aa  130  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  48.7 
 
 
160 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  47.77 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  44.13 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2109  hypothetical protein  47.06 
 
 
182 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  44.59 
 
 
176 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  40 
 
 
181 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  41.4 
 
 
182 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  35.85 
 
 
138 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  43.24 
 
 
146 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  37.18 
 
 
137 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  36.72 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  32.22 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  31.11 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  37.35 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.56 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  28.91 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  29.82 
 
 
169 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  29.82 
 
 
169 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  32.46 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  29.82 
 
 
169 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  28.95 
 
 
169 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  29.34 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  36.99 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  31.67 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  30.09 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  31.25 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  29.31 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  43.64 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  25.93 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  34.21 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.64 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  54.55 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  48.84 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  26.55 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  33.85 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  34.38 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  29.94 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  23.49 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  51.22 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  51.22 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  37.5 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.71 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  51.22 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.13 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  46.34 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  27.35 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  28.7 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  45.65 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>