52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02664 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  100 
 
 		 140 aa  273  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  69.57 
 
 		 163 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  63.77 
 
 		 279 aa  160  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  63.77 
 
 		 184 aa  156  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  33.33 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  35.71 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  41.04 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  34.81 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  34.04 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.88 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  32.87 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  34.11 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  31.72 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  30 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  29.86 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  29.61 
 
 		 169 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  29.61 
 
 		 169 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  28.95 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  30.26 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  40.7 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  31.87 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  29.56 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  27.52 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  32.84 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  29.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  35.23 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  32.31 
 
 		 147 aa  43.5  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  28.76 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  32.18 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  35.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  35.56 
 
 		 220 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  33.72 
 
 		 169 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  40.58 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  29.7 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  30.39 
 
 		 141 aa  40  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  28.68 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>