35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0704 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  72.09 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  55.52 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  55.52 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  55.52 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  46.65 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  33.76 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  46.05 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  35.57 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  36.71 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  31.4 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  34.69 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  28.91 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  36.23 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  33.11 
 
 		 150 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  42.47 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  29.68 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.21 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  34.78 
 
 		 141 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.82 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  42.65 
 
 		 175 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 		 167 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  40.26 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  30.14 
 
 		 162 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  32.65 
 
 		 131 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  40 
 
 		 175 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>