32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10177 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  100 
 
 
322 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  46.65 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  51.08 
 
 
327 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  49.06 
 
 
323 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  49.06 
 
 
323 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  49.06 
 
 
323 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  46.67 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  34.07 
 
 
373 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  42 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  40.91 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  42.19 
 
 
240 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  35.58 
 
 
167 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  42.47 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  42.99 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  34.69 
 
 
198 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  37.36 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  40.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  33.72 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  30.57 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.16 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.16 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  39.44 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  38.03 
 
 
141 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.16 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  27.27 
 
 
205 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.9 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  34.58 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  35.37 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.36 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  30.69 
 
 
167 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  29.51 
 
 
171 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>