24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0134 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  55.52 
 
 
327 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  59.02 
 
 
327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  49.06 
 
 
322 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  41.57 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.7 
 
 
373 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.51 
 
 
198 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 
167 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  35.38 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  40.19 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  44.78 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  40.86 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  43.75 
 
 
361 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  29.76 
 
 
168 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  33.33 
 
 
205 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  28.71 
 
 
166 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
209 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
209 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  33.77 
 
 
141 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  35 
 
 
175 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>