17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2856 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  100 
 
 		 319 aa  604  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  42.01 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  45.89 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  49.65 
 
 		 361 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.1 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  36.71 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  30.49 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  29.82 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  41.74 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 168 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  48.05 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  27.56 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  44 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  44 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  44 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  31.13 
 
 		 167 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  36.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>