19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4810 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  31.15 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1509  hypothetical protein  28.3 
 
 
317 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1482  hypothetical protein  28.3 
 
 
317 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  30.43 
 
 
590 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  28.16 
 
 
514 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  30.23 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  31.8 
 
 
414 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  30.32 
 
 
479 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  33.82 
 
 
430 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  29.93 
 
 
428 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  30 
 
 
422 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  30.05 
 
 
377 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  28.78 
 
 
241 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  24.06 
 
 
362 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  32.28 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  30.33 
 
 
470 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  29.13 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  26.83 
 
 
394 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>