50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2522 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  100 
 
 		 272 aa  520  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  59.93 
 
 		 272 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  47.39 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  49.44 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  52.19 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  49.42 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  49.24 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  48.21 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  46.05 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  38.01 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  43.07 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  45.8 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  45.69 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  45.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  45.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  45.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  44.94 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  43.85 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  46.72 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  41.15 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  41.5 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  37.74 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  42.74 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  43.27 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.55 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  33.85 
 
 		 590 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  34.09 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  34.46 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  34.51 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  30.47 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  33.57 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  25.31 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  35.46 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  26.02 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  29.15 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.97 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  34.46 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.57 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.72 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  42.11 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  28.77 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  25.67 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  26.92 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  22.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  31.67 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  31.77 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  41.67 
 
 		 80 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  30.68 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 		 175 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>