16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1078 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  52.9 
 
 		 150 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1044  RDD domain containing protein  43.21 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  28.29 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  26.71 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  32.43 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  28.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  36.08 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  26.47 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  23.68 
 
 		 340 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  25.83 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  28.12 
 
 		 264 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 		 257 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>