14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2053 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  300  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  52.9 
 
 		 191 aa  149  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1044  RDD domain containing protein  48.34 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.79 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  24.62 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 198 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  31.9 
 
 		 285 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  25.95 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  25.18 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  30.23 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  28.83 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>