23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4626 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28.95 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  31.98 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  29.41 
 
 
447 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  34.3 
 
 
174 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  29.61 
 
 
211 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  26.27 
 
 
242 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  29.94 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  28.33 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  28.82 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 
393 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  30.36 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  32.03 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.88 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  25.7 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  27.54 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.45 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  37.08 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  28.48 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  28.3 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  35.9 
 
 
173 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>