30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0950 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  53.38 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  53.69 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  49.66 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  42.57 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  43.62 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  41.26 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  36.36 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  36.76 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  26.71 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  36.76 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  26.67 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.03 
 
 		 257 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  22.22 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  24.54 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  28.57 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.86 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.75 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  38.71 
 
 		 634 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  25.34 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  27.08 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  34.52 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  25.19 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  34.12 
 
 		 211 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>