13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2964 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  34.27 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0732  RDD domain-containing protein  29.81 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.70222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  45.83 
 
 		 401 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  24.68 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  25.11 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.82 
 
 		 257 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  26.47 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.79 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  25.17 
 
 		 174 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.32 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0451  RDD domain-containing protein  30.2 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>