30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3079 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  100 
 
 		 167 aa  327  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  45.98 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  44.19 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  44.19 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  44.19 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  42.77 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  47.95 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  44.38 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  39.88 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  38.56 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  36 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  36.78 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  33.54 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  38.3 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  37.27 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  31.9 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  34.16 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  33.54 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  32.12 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  32.12 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  33.93 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  32.1 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  38.85 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  30.38 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  32.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  27.2 
 
 		 131 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>