15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3395 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 
221 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  24.86 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.1 
 
 
159 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  22.38 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  24.77 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0374  hypothetical protein  37.04 
 
 
138 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.269123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  24.79 
 
 
393 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  36.21 
 
 
401 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3205  hypothetical protein  58.62 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1161  hypothetical protein  58.62 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  28.43 
 
 
272 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  23.93 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>