66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4142 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  881    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  52.76 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  46.19 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  43.32 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  52.69 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  35.61 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.16 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  39.49 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  35.1 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.98 
 
 		 360 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  31.47 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  32.38 
 
 		 358 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.58 
 
 		 357 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.03 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  34.97 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.52 
 
 		 345 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.85 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  28.64 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.48 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  29.49 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  29.68 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  29.33 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  30.18 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  48.84 
 
 		 392 aa  126  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  29.83 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  28.28 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  41.18 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  41.18 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  41.18 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  41.98 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  21.79 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.02 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.5 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  24.5 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  24.29 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  24.54 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  23.64 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  24.03 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  25.27 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  26.19 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1397 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  28.14 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  27.96 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  27.85 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.49 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  25.93 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1116  hypothetical protein  36.49 
 
 		 471 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  27.59 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  31.45 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  23.37 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  25.93 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  37.14 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  51.28 
 
 		 270 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  37.14 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  51.35 
 
 		 295 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  25.27 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2389  MJ0042 family finger-like protein  33.85 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  44.74 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  23.78 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2908  MJ0042 family finger-like protein  51.52 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2123  hypothetical protein  51.52 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00645364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1951  MJ0042 family finger-like protein  33.71 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.683994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>