53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4879 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  97.22 
 
 		 395 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  98.99 
 
 		 395 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  98.99 
 
 		 395 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  43.86 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  43.61 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  43.61 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  43.36 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  43.42 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  43.03 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  43.61 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  43.11 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  31.79 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  30.05 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  30.05 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.95 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  30.05 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  25.77 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  24.24 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  26.61 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  25.44 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.8 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  26.06 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.03 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.66 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.03 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  24.79 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  26.34 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25.91 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  25.67 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  36.15 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  25.7 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  24.4 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  31.79 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.07 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  30.88 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  33.08 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  23.51 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  22.16 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.56 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  31.88 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  27.56 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  28.66 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1397 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  24.66 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  37.1 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  23.6 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.14 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  24.07 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>