57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1892 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  831    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  55.61 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  55.28 
 
 
419 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  55.04 
 
 
419 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  53.35 
 
 
1397 aa  355  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.03 
 
 
360 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.17 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  28.29 
 
 
356 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  27.9 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  25.5 
 
 
411 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.1 
 
 
395 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  24.15 
 
 
422 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.25 
 
 
345 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  26.82 
 
 
397 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  25.42 
 
 
401 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  40 
 
 
358 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25.58 
 
 
432 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  25.26 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  23.54 
 
 
434 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  25.78 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.77 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  24.51 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  25.18 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  25.81 
 
 
348 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  33.67 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  27.22 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.66 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.43 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  23.77 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  33.59 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  35.07 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  25 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  25 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  25 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  32.06 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  33.11 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.99 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  33.11 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  33.11 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  31.54 
 
 
370 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.25 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  33.57 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  30.66 
 
 
353 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  28.4 
 
 
429 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.88 
 
 
306 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  28.68 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  24.1 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  26.88 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3721  hypothetical protein  45.61 
 
 
153 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  24.1 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  36.73 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  36.73 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  36.73 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  24.1 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  36.73 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  36.73 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>