58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0568 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  786    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  36.67 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  37.63 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  35.62 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.41 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  33.84 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  33.84 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  33.84 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  33.77 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.07 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.25 
 
 		 345 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.31 
 
 		 432 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  29.46 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  27.92 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  30.63 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  31.51 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  29.09 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  47.41 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.02 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  48.84 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  27.37 
 
 		 356 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.11 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.11 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  48.91 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  27.54 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  26.4 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  26.05 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.48 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  23.47 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  23.47 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  23.53 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  24.48 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.74 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  25.07 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  23.99 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  23.99 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  23.99 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  24.51 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  23.99 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  23.99 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  28.52 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  24.21 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.99 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.09 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  32.09 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  22.86 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  22.92 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  29.77 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  42.37 
 
 		 1397 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  30.89 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  28.68 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  23.43 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.03 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  29.2 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3721  hypothetical protein  37.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>