47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3400 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  32.18 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  31.53 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  30.66 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.45 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  38.12 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  39.74 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  35.71 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  26.92 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  38.06 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  24.93 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  26.46 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  22.56 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  25.14 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.93 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.48 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  23.65 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  24.38 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  26.28 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.71 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  23.77 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  24.23 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  25.4 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  20.92 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  23.77 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  25.61 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  22.96 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  23.46 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  23 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  22.33 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  21.94 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  22.26 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.01 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  22.59 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  23.68 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  35.14 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.65 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  26.28 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  26.28 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  26.28 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  28.45 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  25.89 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  29.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  29.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  23.94 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  28.99 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>