40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3236 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  58.64 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  57.48 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  60.29 
 
 		 306 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  47.54 
 
 		 377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  34.65 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  31.77 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  38.71 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2291  hypothetical protein  52.25 
 
 		 110 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  34.55 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.54 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  28.41 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  29.08 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.09 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  29.76 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.08 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  29.32 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  23.81 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.13 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  26.86 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  31.45 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  28.57 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  27.34 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.96 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  27.82 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25.17 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.33 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.37 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  31.21 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  43.4 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  29.2 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  24.29 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  29.17 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>