58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0377 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  792    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  80.92 
 
 		 393 aa  587  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  61.21 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  61.46 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  61.21 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  37.63 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  34.72 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  32.23 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.95 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  31.41 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.87 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  31.93 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  30.71 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  30.75 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  30.89 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  30.46 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  30.61 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.08 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.55 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  29.21 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  30.29 
 
 		 437 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.26 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  45.52 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  30.69 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.81 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  44.06 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  30.28 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  30.47 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  30.47 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  30 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  30 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  30.47 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  29.53 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  30.61 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  31.4 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  28.57 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  28.35 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  27.99 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.92 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  44.19 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.23 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.04 
 
 		 321 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  24.26 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  23.9 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  30.06 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1397 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  23.51 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  27.98 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  42.31 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  29.17 
 
 		 353 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  31.36 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  27.34 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  30.15 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.38 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>