59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0387 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  100 
 
 
360 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  56.86 
 
 
372 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  40.46 
 
 
345 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  40.29 
 
 
358 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  37.32 
 
 
360 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  37.32 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  37.94 
 
 
401 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  35.96 
 
 
422 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  33.86 
 
 
392 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  36.26 
 
 
358 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  36.07 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.63 
 
 
432 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  39.02 
 
 
366 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.44 
 
 
408 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  36.42 
 
 
437 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  37.71 
 
 
421 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  33.92 
 
 
398 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  30.51 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  33.92 
 
 
398 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  34.17 
 
 
398 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  33.85 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  39.32 
 
 
376 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  32.19 
 
 
434 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  35.71 
 
 
391 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  29.86 
 
 
411 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  34.04 
 
 
397 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  36.47 
 
 
348 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.9 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  35.82 
 
 
395 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.62 
 
 
395 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  32.26 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  26.99 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  25.33 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  25.86 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  25.87 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  26.01 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  25.37 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  39.2 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  39.2 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  36.18 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  39.2 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  40 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  39.2 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  39.2 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  40 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.31 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  28.62 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  32.31 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  23.89 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  33.06 
 
 
419 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  51.79 
 
 
1397 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  28.49 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  28.5 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  29.88 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  27.51 
 
 
430 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.59 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  26.5 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1863  hypothetical protein  38.33 
 
 
120 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>