35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3692 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  60.43 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  31.78 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  31.55 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  48.84 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  41.67 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  33.97 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  31.07 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  27.2 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.93 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25.12 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  28.35 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  26.02 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.46 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  26.74 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  26.27 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  22.7 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.95 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.03 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  25.45 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  24.06 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  29.41 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.56 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  22.26 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  27.96 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  23.78 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.86 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  23.68 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  24.2 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  26.97 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  25.25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  23.81 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  23.24 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  31.08 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>