41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2015 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  88.34 
 
 		 429 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  834    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  98.28 
 
 		 306 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  58.64 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2291  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  33.74 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3692  hypothetical protein  31.13 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  33.02 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  38.12 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  30.93 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  26.98 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  29.38 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  27.94 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.11 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.09 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  28.5 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  28.49 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  25.08 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  27.98 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  26.24 
 
 		 358 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  26.63 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.86 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.1 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  30.97 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  27.56 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  28.68 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.59 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  23.61 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  27.48 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  25.15 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  30.63 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  32 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  24.07 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  26.77 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  25 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  24.53 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.63 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  33.63 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  23.66 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>