49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2076 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  100 
 
 		 348 aa  684    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  40.17 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  39.77 
 
 		 434 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  41.86 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  38.3 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  39.76 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  40.64 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  38.48 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  37.76 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  38.42 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  35.45 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  37.46 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  38.95 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  36.63 
 
 		 437 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  37.61 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.67 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  37.75 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  36 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  35.05 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  30.43 
 
 		 411 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.14 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  33.69 
 
 		 397 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  29.79 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.39 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  31.68 
 
 		 392 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  30.42 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.75 
 
 		 393 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  31.52 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  28.76 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  45.74 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  45.74 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  26.77 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  24.56 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  30.83 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  23.49 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1397 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  31.21 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  34.96 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  34.96 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  34.96 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  34.96 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  34.96 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  34.96 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  34.96 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.96 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  24.79 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  25.6 
 
 		 429 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>