20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3721 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3721  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1863  hypothetical protein  68.63 
 
 
120 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7219  hypothetical protein  62.16 
 
 
114 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.54392  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4088  hypothetical protein  59.38 
 
 
139 aa  120  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1544  hypothetical protein  52.13 
 
 
106 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000142807  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0017  hypothetical protein  51.09 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.45132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0405  hypothetical protein  34.74 
 
 
117 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1998  hypothetical protein  55.17 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0409  hypothetical protein  36.23 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.391541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  30.68 
 
 
401 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  45.1 
 
 
1397 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  50 
 
 
419 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  37.29 
 
 
392 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  29.55 
 
 
437 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  30.26 
 
 
356 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  31.17 
 
 
421 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  33.82 
 
 
348 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  28.57 
 
 
377 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  30.67 
 
 
366 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.08 
 
 
432 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>