55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4828 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  97.49 
 
 
398 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  98.99 
 
 
398 aa  803    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  97.99 
 
 
407 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  97.24 
 
 
407 aa  705    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  99.5 
 
 
398 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  809    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  98.74 
 
 
398 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  98.99 
 
 
398 aa  803    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  43.03 
 
 
395 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  42.79 
 
 
395 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  42.54 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  42.46 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  30.45 
 
 
393 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  31.68 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  31.94 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  30.99 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  26.26 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  25.26 
 
 
392 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  33.14 
 
 
422 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  39.2 
 
 
360 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  25.57 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  24.54 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  40.85 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.25 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.01 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.91 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.91 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  34.06 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  31.51 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.43 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  31.21 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  29.93 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.04 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  28.31 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  23.04 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  25.38 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  26.72 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.61 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  28.67 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  38.16 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  27.59 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  35.77 
 
 
348 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  29.13 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  33.07 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  37.29 
 
 
1397 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.33 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  31.88 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  26.36 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  34.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  33.33 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  23.24 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  36.73 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.26 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  27.74 
 
 
306 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>