18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1951 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1951  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 321 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2389  MJ0042 family finger-like protein  37.04 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2123  hypothetical protein  29.04 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00645364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1116  hypothetical protein  29.12 
 
 		 471 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2908  MJ0042 family finger-like protein  37 
 
 		 566 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0595  hypothetical protein  25.87 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4351  regulator of chromosome condensation RCC1  27.32 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4328  hypothetical protein  27.84 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.459893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4196  hypothetical protein  27.32 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4345  hypothetical protein  31.91 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.58775  normal  0.280629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.24 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  32.35 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.19 
 
 		 2313 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0190  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0243278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  39.53 
 
 		 1124 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2859  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  28.67 
 
 		 1056 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>