33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0479 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  37.02 
 
 
248 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  33.99 
 
 
304 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  34.34 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  64.86 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  64.86 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  48.65 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  32.52 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  40.82 
 
 
1244 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  47.22 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  47.22 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  45 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  45.71 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  45.95 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1951  MJ0042 family finger-like protein  32.35 
 
 
321 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  42.86 
 
 
1124 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  48.57 
 
 
308 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  41.67 
 
 
255 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  41.67 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  37.5 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 
1163 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 
1139 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 
1144 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  41.46 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  25.58 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  34.29 
 
 
361 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  40 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>